LRP1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
LRP1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи LRP1, A2MR, APOER, APR, CD91, IGFBP3R, LRP, LRP1A, TGFBR5, low density lipoprotein receptor-related protein 1, LDL receptor related protein 1, KPA, IGFBP3R1, IGFBP-3R
Зовнішні ІД OMIM: 107770 MGI: 96828 HomoloGene: 1744 GeneCards: LRP1
Пов'язані генетичні захворювання
мігрень, migraine without aura, Аневризма черевної аорти[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_002332
NM_008512
RefSeq (білок)
NP_002323
NP_032538
Локус (UCSC) Хр. 12: 57.13 – 57.21 Mb Хр. 10: 127.37 – 127.46 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LRP1 (англ. LDL receptor related protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 544 амінокислот, а молекулярна маса — 504 606[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MLTPPLLLLLPLLSALVAAAIDAPKTCSPKQFACRDQITCISKGWRCDGE
RDCPDGSDEAPEICPQSKAQRCQPNEHNCLGTELCVPMSRLCNGVQDCMD
GSDEGPHCRELQGNCSRLGCQHHCVPTLDGPTCYCNSSFQLQADGKTCKD
FDECSVYGTCSQLCTNTDGSFICGCVEGYLLQPDNRSCKAKNEPVDRPPV
LLIANSQNILATYLSGAQVSTITPTSTRQTTAMDFSYANETVCWVHVGDS
AAQTQLKCARMPGLKGFVDEHTINISLSLHHVEQMAIDWLTGNFYFVDDI
DDRIFVCNRNGDTCVTLLDLELYNPKGIALDPAMGKVFFTDYGQIPKVER
CDMDGQNRTKLVDSKIVFPHGITLDLVSRLVYWADAYLDYIEVVDYEGKG
RQTIIQGILIEHLYGLTVFENYLYATNSDNANAQQKTSVIRVNRFNSTEY
QVVTRVDKGGALHIYHQRRQPRVRSHACENDQYGKPGGCSDICLLANSHK
ARTCRCRSGFSLGSDGKSCKKPEHELFLVYGKGRPGIIRGMDMGAKVPDE
HMIPIENLMNPRALDFHAETGFIYFADTTSYLIGRQKIDGTERETILKDG
IHNVEGVAVDWMGDNLYWTDDGPKKTISVARLEKAAQTRKTLIEGKMTHP
RAIVVDPLNGWMYWTDWEEDPKDSRRGRLERAWMDGSHRDIFVTSKTVLW
PNGLSLDIPAGRLYWVDAFYDRIETILLNGTDRKIVYEGPELNHAFGLCH
HGNYLFWTEYRSGSVYRLERGVGGAPPTVTLLRSERPPIFEIRMYDAQQQ
QVGTNKCRVNNGGCSSLCLATPGSRQCACAEDQVLDADGVTCLANPSYVP
PPQCQPGEFACANSRCIQERWKCDGDNDCLDNSDEAPALCHQHTCPSDRF
KCENNRCIPNRWLCDGDNDCGNSEDESNATCSARTCPPNQFSCASGRCIP
ISWTCDLDDDCGDRSDESASCAYPTCFPLTQFTCNNGRCININWRCDNDN
DCGDNSDEAGCSHSCSSTQFKCNSGRCIPEHWTCDGDNDCGDYSDETHAN
CTNQATRPPGGCHTDEFQCRLDGLCIPLRWRCDGDTDCMDSSDEKSCEGV
THVCDPSVKFGCKDSARCISKAWVCDGDNDCEDNSDEENCESLACRPPSH
PCANNTSVCLPPDKLCDGNDDCGDGSDEGELCDQCSLNNGGCSHNCSVAP
GEGIVCSCPLGMELGPDNHTCQIQSYCAKHLKCSQKCDQNKFSVKCSCYE
GWVLEPDGESCRSLDPFKPFIIFSNRHEIRRIDLHKGDYSVLVPGLRNTI
ALDFHLSQSALYWTDVVEDKIYRGKLLDNGALTSFEVVIQYGLATPEGLA
VDWIAGNIYWVESNLDQIEVAKLDGTLRTTLLAGDIEHPRAIALDPRDGI
LFWTDWDASLPRIEAASMSGAGRRTVHRETGSGGWPNGLTVDYLEKRILW
IDARSDAIYSARYDGSGHMEVLRGHEFLSHPFAVTLYGGEVYWTDWRTNT
LAKANKWTGHNVTVVQRTNTQPFDLQVYHPSRQPMAPNPCEANGGQGPCS
HLCLINYNRTVSCACPHLMKLHKDNTTCYEFKKFLLYARQMEIRGVDLDA
PYYNYIISFTVPDIDNVTVLDYDAREQRVYWSDVRTQAIKRAFINGTGVE
TVVSADLPNAHGLAVDWVSRNLFWTSYDTNKKQINVARLDGSFKNAVVQG
LEQPHGLVVHPLRGKLYWTDGDNISMANMDGSNRTLLFSGQKGPVGLAID
FPESKLYWISSGNHTINRCNLDGSGLEVIDAMRSQLGKATALAIMGDKLW
WADQVSEKMGTCSKADGSGSVVLRNSTTLVMHMKVYDESIQLDHKGTNPC
SVNNGDCSQLCLPTSETTRSCMCTAGYSLRSGQQACEGVGSFLLYSVHEG
IRGIPLDPNDKSDALVPVSGTSLAVGIDFHAENDTIYWVDMGLSTISRAK
RDQTWREDVVTNGIGRVEGIAVDWIAGNIYWTDQGFDVIEVARLNGSFRY
VVISQGLDKPRAITVHPEKGYLFWTEWGQYPRIERSRLDGTERVVLVNVS
ISWPNGISVDYQDGKLYWCDARTDKIERIDLETGENREVVLSSNNMDMFS
VSVFEDFIYWSDRTHANGSIKRGSKDNATDSVPLRTGIGVQLKDIKVFNR
DRQKGTNVCAVANGGCQQLCLYRGRGQRACACAHGMLAEDGASCREYAGY
LLYSERTILKSIHLSDERNLNAPVQPFEDPEHMKNVIALAFDYRAGTSPG
TPNRIFFSDIHFGNIQQINDDGSRRITIVENVGSVEGLAYHRGWDTLYWT
SYTTSTITRHTVDQTRPGAFERETVITMSGDDHPRAFVLDECQNLMFWTN
WNEQHPSIMRAALSGANVLTLIEKDIRTPNGLAIDHRAEKLYFSDATLDK
IERCEYDGSHRYVILKSEPVHPFGLAVYGEHIFWTDWVRRAVQRANKHVG
SNMKLLRVDIPQQPMGIIAVANDTNSCELSPCRINNGGCQDLCLLTHQGH
VNCSCRGGRILQDDLTCRAVNSSCRAQDEFECANGECINFSLTCDGVPHC
KDKSDEKPSYCNSRRCKKTFRQCSNGRCVSNMLWCNGADDCGDGSDEIPC
NKTACGVGEFRCRDGTCIGNSSRCNQFVDCEDASDEMNCSATDCSSYFRL
GVKGVLFQPCERTSLCYAPSWVCDGANDCGDYSDERDCPGVKRPRCPLNY
FACPSGRCIPMSWTCDKEDDCEHGEDETHCNKFCSEAQFECQNHRCISKQ
WLCDGSDDCGDGSDEAAHCEGKTCGPSSFSCPGTHVCVPERWLCDGDKDC
ADGADESIAAGCLYNSTCDDREFMCQNRQCIPKHFVCDHDRDCADGSDES
PECEYPTCGPSEFRCANGRCLSSRQWECDGENDCHDQSDEAPKNPHCTSQ
EHKCNASSQFLCSSGRCVAEALLCNGQDDCGDSSDERGCHINECLSRKLS
GCSQDCEDLKIGFKCRCRPGFRLKDDGRTCADVDECSTTFPCSQRCINTH
GSYKCLCVEGYAPRGGDPHSCKAVTDEEPFLIFANRYYLRKLNLDGSNYT
LLKQGLNNAVALDFDYREQMIYWTDVTTQGSMIRRMHLNGSNVQVLHRTG
LSNPDGLAVDWVGGNLYWCDKGRDTIEVSKLNGAYRTVLVSSGLREPRAL
VVDVQNGYLYWTDWGDHSLIGRIGMDGSSRSVIVDTKITWPNGLTLDYVT
ERIYWADAREDYIEFASLDGSNRHVVLSQDIPHIFALTLFEDYVYWTDWE
TKSINRAHKTTGTNKTLLISTLHRPMDLHVFHALRQPDVPNHPCKVNNGG
CSNLCLLSPGGGHKCACPTNFYLGSDGRTCVSNCTASQFVCKNDKCIPFW
WKCDTEDDCGDHSDEPPDCPEFKCRPGQFQCSTGICTNPAFICDGDNDCQ
DNSDEANCDIHVCLPSQFKCTNTNRCIPGIFRCNGQDNCGDGEDERDCPE
VTCAPNQFQCSITKRCIPRVWVCDRDNDCVDGSDEPANCTQMTCGVDEFR
CKDSGRCIPARWKCDGEDDCGDGSDEPKEECDERTCEPYQFRCKNNRCVP
GRWQCDYDNDCGDNSDEESCTPRPCSESEFSCANGRCIAGRWKCDGDHDC
ADGSDEKDCTPRCDMDQFQCKSGHCIPLRWRCDADADCMDGSDEEACGTG
VRTCPLDEFQCNNTLCKPLAWKCDGEDDCGDNSDENPEECARFVCPPNRP
FRCKNDRVCLWIGRQCDGTDNCGDGTDEEDCEPPTAHTTHCKDKKEFLCR
NQRCLSSSLRCNMFDDCGDGSDEEDCSIDPKLTSCATNASICGDEARCVR
TEKAAYCACRSGFHTVPGQPGCQDINECLRFGTCSQLCNNTKGGHLCSCA
RNFMKTHNTCKAEGSEYQVLYIADDNEIRSLFPGHPHSAYEQAFQGDESV
RIDAMDVHVKAGRVYWTNWHTGTISYRSLPPAAPPTTSNRHRRQIDRGVT
HLNISGLKMPRGIAIDWVAGNVYWTDSGRDVIEVAQMKGENRKTLISGMI
DEPHAIVVDPLRGTMYWSDWGNHPKIETAAMDGTLRETLVQDNIQWPTGL
AVDYHNERLYWADAKLSVIGSIRLNGTDPIVAADSKRGLSHPFSIDVFED
YIYGVTYINNRVFKIHKFGHSPLVNLTGGLSHASDVVLYHQHKQPEVTNP
CDRKKCEWLCLLSPSGPVCTCPNGKRLDNGTCVPVPSPTPPPDAPRPGTC
NLQCFNGGSCFLNARRQPKCRCQPRYTGDKCELDQCWEHCRNGGTCAASP
SGMPTCRCPTGFTGPKCTQQVCAGYCANNSTCTVNQGNQPQCRCLPGFLG
DRCQYRQCSGYCENFGTCQMAADGSRQCRCTAYFEGSRCEVNKCSRCLEG
ACVVNKQSGDVTCNCTDGRVAPSCLTCVGHCSNGGSCTMNSKMMPECQCP
PHMTGPRCEEHVFSQQQPGHIASILIPLLLLLLLVLVAGVVFWYKRRVQG
AKGFQHQRMTNGAMNVEIGNPTYKMYEGGEPDDVGGLLDADFALDPDKPT
NFTNPVYATLYMGGHGSRHSLASTDEKRELLGRGPEDEIGDPLA

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі як ендоцитоз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани.

Література

[ред. | ред. код]
  • Van Leuven F., Stas L., Thiry E., Nelissen B., Miyake Y. (1998). Strategy to sequence the 89 exons of the human LRP1 gene coding for the lipoprotein receptor related protein: identification of one expressed mutation among 48 polymorphisms. Genomics. 52: 138—144. PMID 9782078 DOI:10.1006/geno.1998.5408
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • May P., Reddy Y.K., Herz J. (2002). Proteolytic processing of low density lipoprotein receptor-related protein mediates regulated release of its intracellular domain. J. Biol. Chem. 277: 18736—18743. PMID 11907044 DOI:10.1074/jbc.M201979200
  • Kinoshita A., Shah T., Tangredi M.M., Strickland D.K., Hyman B.T. (2003). The intracellular domain of the low density lipoprotein receptor-related protein modulates transactivation mediated by amyloid precursor protein and Fe65. J. Biol. Chem. 278: 41182—41188. PMID 12888553 DOI:10.1074/jbc.M306403200
  • May P., Herz J. (2003). LDL receptor-related proteins in neurodevelopment. Traffic. 4: 291—301. PMID 12713657 DOI:10.1034/j.1600-0854.2003.00086_4_5.x
  • Huang W., Dolmer K., Gettins P.G.W. (1999). NMR solution structure of complement-like repeat CR8 from the low density lipoprotein receptor-related protein. J. Biol. Chem. 274: 14130—14136. PMID 10318830 DOI:10.1074/jbc.274.20.14130

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з LRP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6692 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, Q07954 (англ.) . Архів оригіналу за 2 грудня 2008. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]