UTRN

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
UTRN
Наявні структури
PDBПошук для людей: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи UTRN, DMDL, DRP, DRP1, utrophin
Зовнішні ІД OMIM: 128240 MGI: 104631 HomoloGene: 21398 GeneCards: UTRN
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_007124
NM_001375323
NM_011682
RefSeq (білок)
NP_009055
NP_001362252
н/д
Локус (UCSC) Хр. 6: 144.29 – 144.85 Mb Хр. 10: 12.26 – 12.75 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

UTRN (англ. Utrophin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 433 амінокислот, а молекулярна маса — 394 466[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAKYGEHEASPDNGQNEFSDIIKSRSDEHNDVQKKTFTKWINARFSKSGK
PPINDMFTDLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALNNVNRVLQVL
HQNNVELVNIGGTDIVDGNHKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDVMSDLQQT
NSEKILLSWVRQTTRPYSQVNVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWD
KVVKMSPIERLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVQLPDKKSIIMYLTSL
FEVLPQQVTIDAIREVETLPRKYKKECEEEAINIQSTAPEEEHESPRAET
PSTVTEVDMDLDSYQIALEEVLTWLLSAEDTFQEQDDISDDVEEVKDQFA
THEAFMMELTAHQSSVGSVLQAGNQLITQGTLSDEEEFEIQEQMTLLNAR
WEALRVESMDRQSRLHDVLMELQKKQLQQLSAWLTLTEERIQKMETCPLD
DDVKSLQKLLEEHKSLQSDLEAEQVKVNSLTHMVVIVDENSGESATAILE
DQLQKLGERWTAVCRWTEERWNRLQEINILWQELLEEQCLLKAWLTEKEE
ALNKVQTSNFKDQKELSVSVRRLAILKEDMEMKRQTLDQLSEIGQDVGQL
LDNSKASKKINSDSEELTQRWDSLVQRLEDSSNQVTQAVAKLGMSQIPQK
DLLETVRVREQAITKKSKQELPPPPPPKKRQIHVDIEAKKKFDAISAELL
NWILKWKTAIQTTEIKEYMKMQDTSEMKKKLKALEKEQRERIPRADELNQ
TGQILVEQMGKEGLPTEEIKNVLEKVSSEWKNVSQHLEDLERKIQLQEDI
NAYFKQLDELEKVIKTKEEWVKHTSISESSRQSLPSLKDSCQRELTNLLG
LHPKIEMARASCSALMSQPSAPDFVQRGFDSFLGRYQAVQEAVEDRQQHL
ENELKGQPGHAYLETLKTLKDVLNDSENKAQVSLNVLNDLAKVEKALQEK
KTLDEILENQKPALHKLAEETKALEKNVHPDVEKLYKQEFDDVQGKWNKL
KVLVSKDLHLLEEIALTLRAFEADSTVIEKWMDGVKDFLMKQQAAQGDDA
GLQRQLDQCSAFVNEIETIESSLKNMKEIETNLRSGPVAGIKTWVQTRLG
DYQTQLEKLSKEIATQKSRLSESQEKAANLKKDLAEMQEWMTQAEEEYLE
RDFEYKSPEELESAVEEMKRAKEDVLQKEVRVKILKDNIKLLAAKVPSGG
QELTSELNVVLENYQLLCNRIRGKCHTLEEVWSCWIELLHYLDLETTWLN
TLEERMKSTEVLPEKTDAVNEALESLESVLRHPADNRTQIRELGQTLIDG
GILDDIISEKLEAFNSRYEDLSHLAESKQISLEKQLQVLRETDQMLQVLQ
ESLGELDKQLTTYLTDRIDAFQVPQEAQKIQAEISAHELTLEELRRNMRS
QPLTSPESRTARGGSQMDVLQRKLREVSTKFQLFQKPANFEQRMLDCKRV
LDGVKAELHVLDVKDVDPDVIQTHLDKCMKLYKTLSEVKLEVETVIKTGR
HIVQKQQTDNPKGMDEQLTSLKVLYNDLGAQVTEGKQDLERASQLARKMK
KEAASLSEWLSATETELVQKSTSEGLLGDLDTEISWAKNVLKDLEKRKAD
LNTITESSAALQNLIEGSEPILEERLCVLNAGWSRVRTWTEDWCNTLMNH
QNQLEIFDGNVAHISTWLYQAEALLDEIEKKPTSKQEEIVKRLVSELDDA
NLQVENVRDQALILMNARGSSSRELVEPKLAELNRNFEKVSQHIKSAKLL
IAQEPLYQCLVTTETFETGVPFSDLEKLENDIENMLKFVEKHLESSDEDE
KMDEESAQIEEVLQRGEEMLHQPMEDNKKEKIRLQLLLLHTRYNKIKAIP
IQQRKMGQLASGIRSSLLPTDYLVEINKILLCMDDVELSLNVPELNTAIY
EDFSFQEDSLKNIKDQLDKLGEQIAVIHEKQPDVILEASGPEAIQIRDTL
TQLNAKWDRINRMYSDRKGCFDRAMEEWRQFHCDLNDLTQWITEAEELLV
DTCAPGGSLDLEKARIHQQELEVGISSHQPSFAALNRTGDGIVQKLSQAD
GSFLKEKLAGLNQRWDAIVAEVKDRQPRLKGESKQVMKYRHQLDEIICWL
TKAEHAMQKRSTTELGENLQELRDLTQEMEVHAEKLKWLNRTELEMLSDK
SLSLPERDKISESLRTVNMTWNKICREVPTTLKECIQEPSSVSQTRIAAH
PNVQKVVLVSSASDIPVQSHRTSEISIPADLDKTITELADWLVLIDQMLK
SNIVTVGDVEEINKTVSRMKITKADLEQRHPQLDYVFTLAQNLKNKASSS
DMRTAITEKLERVKNQWDGTQHGVELRQQQLEDMIIDSLQWDDHREETEE
LMRKYEARLYILQQARRDPLTKQISDNQILLQELGPGDGIVMAFDNVLQK
LLEEYGSDDTRNVKETTEYLKTSWINLKQSIADRQNALEAEWRTVQASRR
DLENFLKWIQEAETTVNVLVDASHRENALQDSILARELKQQMQDIQAEID
AHNDIFKSIDGNRQKMVKALGNSEEATMLQHRLDDMNQRWNDLKAKSASI
RAHLEASAEKWNRLLMSLEELIKWLNMKDEELKKQMPIGGDVPALQLQYD
HCKALRRELKEKEYSVLNAVDQARVFLADQPIEAPEEPRRNLQSKTELTP
EERAQKIAKAMRKQSSEVKEKWESLNAVTSNWQKQVDKALEKLRDLQGAM
DDLDADMKEAESVRNGWKPVGDLLIDSLQDHIEKIMAFREEIAPINFKVK
TVNDLSSQLSPLDLHPSLKMSRQLDDLNMRWKLLQVSVDDRLKQLQEAHR
DFGPSSQHFLSTSVQLPWQRSISHNKVPYYINHQTQTTCWDHPKMTELFQ
SLADLNNVRFSAYRTAIKIRRLQKALCLDLLELSTTNEIFKQHKLNQNDQ
LLSVPDVINCLTTTYDGLEQMHKDLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGK
IRVQSLKIGLMSLSKGLLEEKYRYLFKEVAGPTEMCDQRQLGLLLHDAIQ
IPRQLGEVAAFGGSNIEPSVRSCFQQNNNKPEISVKEFIDWMHLEPQSMV
WLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIVGFRYRSLKHFNYDVCQSCFFS
GRTAKGHKLHYPMVEYCIPTTSGEDVRDFTKVLKNKFRSKKYFAKHPRLG
YLPVQTVLEGDNLETPITLISMWPEHYDPSQSPQLFHDDTHSRIEQYATR
LAQMERTNGSFLTDSSSTTGSVEDEHALIQQYCQTLGGESPVSQPQSPAQ
ILKSVEREERGELERIIADLEEEQRNLQVEYEQLKDQHLRRGLPVGSPPE
SIISPHHTSEDSELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLESQLHRLR
QLLEQPESDSRINGVSPWASPQHSALSYSLDPDASGPQFHQAAGEDLLAP
PHDTSTDLTEVMEQIHSTFPSCCPNVPSRPQAM

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

[ред. | ред. код]
  • Wilson J., Putt W., Jimenez C., Edwards Y.H. (1999). Up71 and up140, two novel transcripts of utrophin that are homologues of short forms of dystrophin. Hum. Mol. Genet. 8: 1271—1278. PMID 10369873 DOI:10.1093/hmg/8.7.1271
  • Burton E.A., Tinsley J.M., Holzfeind P.J., Rodrigues N.R., Davies K.E. (1999). A second promoter provides an alternative target for therapeutic up-regulation of utrophin in Duchenne muscular dystrophy. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 14025—14030. PMID 10570192 DOI:10.1073/pnas.96.24.14025
  • Ahn A.H., Kunkel L.M. (1995). Syntrophin binds to an alternatively spliced exon of dystrophin. J. Cell Biol. 128: 363—371. PMID 7844150 DOI:10.1083/jcb.128.3.363
  • Tommasi di Vignano A., Di Zenzo G., Sudol M., Cesareni G., Dente L. (2000). Contribution of the different modules in the utrophin carboxy-terminal region to the formation and regulation of the DAP complex. FEBS Lett. 471: 229—234. PMID 10767429 DOI:10.1016/S0014-5793(00)01400-9
  • Bhosle R.C., Michele D.E., Campbell K.P., Li Z., Robson R.M. (2006). Interactions of intermediate filament protein synemin with dystrophin and utrophin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 346: 768—777. PMID 16777071 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.05.192
  • Singh S.M., Bandi S., Winder S.J., Mallela K.M. (2014). The actin binding affinity of the utrophin tandem calponin-homology domain is primarily determined by its N-terminal domain. Biochemistry. 53: 1801—1809. PMID 24628267 DOI:10.1021/bi500149q

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12635 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, P46939 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]